他们去抢了一艘携带核子加农炮的潜艇，9S破译出了核子加农炮的密钥，正当他们准备进攻一位对敌人有巨大影响的将军的城堡时，基地被发现了。9S加载了山姆的数据，虽然机体差了点，但和刃狼配合解决掉第一波敌人绰绰有余。敌人的武器甚至无法击破他们的装甲。更好玩的是敌军带了一种有高智能AI的机械猎犬，而他们又没有强行控制这些猎犬的开关。于是刃狼一声嚎叫，所有的猎犬都造反了，开始掉头攻击他们之前的队友。
因为基地已经被发现，抵抗军不能坐以待毙，他们将基地转移到抢来的潜艇上。但猎犬太大登不上直升机，于是刃狼带领猎犬突破了当地军火库，救出一群猎犬从陆路转移。
在敌人专心追捕逃跑的猎犬时，潜艇开到了城堡，他们没有立刻使用核武器，因为里面还有囚犯，虽然少，但也必须要救出来。他们炸开了外墙，威廉和依诺杀进去救人，人救出来了，但威廉和依诺被电梯送到了那个将军面前。
那个将军用很类似无畏机甲的自动机甲迎击，不过那里面装的不是他自己人，而是威廉以前的战友，在战斗的时候还给予对方心灵上的重击。在让那个机甲失去动力后，那个将军驾驶着一架带护盾的机甲出现，但他的护盾挡不住相位刀，在护盾破掉后，他被从机甲里拽出来。他最后的反抗是拿出手雷试图让自己和对方同归于尽，但站在他面前的是依诺，他确实碎了，依诺身上连个划痕都没有。
两人离开城堡，潜艇发射核弹，然后潜入水下逃遁，敌军追都追不上他们。接下来的十几天，刃狼带着一群狗打游击，时不时再收编几个新成员。残疾的那位接受了治疗，回来之后不仅能站起来了，整个人都精神了不少，老兵为了战斗喝了延寿药物，威廉做了一点生化改造，还拿到了神禁学社提供的一套不算太高级但够用的动力甲。这种动力甲很适合没有任何改造的普通人，而且造价相对低廉，于是机械教将其改进了一下，配发给了骑士家族的下级士兵。敌人的武器和星界军手里的那些手电筒不相上下，没有必要更换。
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